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WB(WesternBlot)是一種常用的生物化學實驗技術,用于檢測和分析蛋白樣品中特定蛋白質的存在和表達水平。它通過將樣品中的蛋白質分離并轉移到膜上,然后使用特定的抗體識別目標蛋白,并通過化學或免疫檢測方法來可視化這些蛋白質。WesternBlot技術通常包括樣品制備、SDS-PAGE電泳分離、蛋白轉印、封閉和抗體檢測、曝光顯影等步驟。目前WB被廣泛應用于生物醫(yī)學研究中,用于研究蛋白質表達、翻譯后修飾以及蛋白質相互作用等。
圖1.WB流程圖
在日常實驗過程中,小分子蛋白是非常常見的,小分子蛋白是指待檢測的蛋白分子量小于20kda,常見的凋亡蛋白如Bcl2、Caspase-3、Bax,自噬相關蛋白如LC3B等均為小分子蛋白,這類蛋白由于較小的分子量,易受到凝膠網孔的影響在電泳過程中彌散,導致難以分離和檢測。因此,為了檢測到小分子量的蛋白,需要對實驗步驟進行一些優(yōu)化,以提高實驗成功率。
1. 配膠:整體配膠遵循蛋白分子量越小膠濃度越大的原則,對于小分子蛋白來說,分離膠濃度一般為12%-15%,對于小分子蛋白條帶可以分的更加清晰。同時在倒膠時濃縮膠的比例可以適當增加到4:6,使其充分濃縮,后續(xù)電泳過程中一定程度上可以減少彌散。15-20kda可選擇12%的凝膠;10-15kda可選擇13.5%的凝膠;小于10kda的蛋白用15%的凝膠或者用Tricine-SDS-PAGE凝膠電泳體系。與傳統(tǒng)的Gly-SDS-PAGE相比,Tricine-SDS-PAGE使用三羥甲基氨基甘氨酸(Tricine)代替甘氨酸(Gly),具有更好的小分子蛋白分離效果。
2. 上樣:根據日常上樣經驗,建議在跑小分子蛋白時增加1倍上樣量,防止蛋白彌散過多。選擇marker時,選擇適用于小分子蛋白的marker,后續(xù)敷抗體時可以更清楚的進行裁膜。電泳開始前可用1′loadingbuffer補齊未點樣的膠孔,防止兩邊不齊跑成“八"字。
圖1:賽默飛marker示意圖(左:常規(guī)蛋白marker;右:小分子蛋白marker)
3. 電泳:濃縮膠部分設置恒壓70V、30min左右,一般即可濃縮到一條線上之后調大電壓至110V,至所需蛋白區(qū)域全部分開為止。盡量避免長時間低電壓跑膠,易導致蛋白彌散過多。同時整個電泳過程中注意降溫。
4. 轉膜:由于小分子蛋白分子量小,吸附能力弱,因此轉膜時選擇0.22μm的PVDF膜,常規(guī)0.45μm膜容易穿透,剩余條件同正常蛋白一般可以滿足條件。
5. 封閉:快速封閉液或脫脂牛奶按正常條件封閉即可。裁膜時根據marker上下留出足夠多的空間。
6. 一抗孵育:在保證上述條件的基礎上,一抗是出好結果的關鍵一步,若沒前期實驗經驗,一抗的稀釋比一般按照說明書配置,若有前期實驗的經驗,可適當進行比例調整,一抗?jié)舛冗^高最后顯影階段易出現(xiàn)雜帶,過低則可能看不到條帶。使用1′TBST緩沖液稀釋,4℃孵育過夜。
7. 后續(xù)二抗比例及孵育時間、顯影按常規(guī)操作即可。需要注意若抗體不好用或者蛋白難出結果,在敷完一二抗時可適當延長洗膜時間及次數。
注意事項:
1. 轉膜時,若蛋白分子量過小,可適當提高甲醇比例(30%左右)改善吸附能力。
2. 跑小分子蛋白時marker盡量不跑到一張膜上,對于常見內參GAPDH、Actin及Tubulin等來說,分離膠濃度大上述蛋白區(qū)域一般分不開或分離不完整,易導致內參不齊。
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